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免费方式 | N/A |
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采购渠道 | 官网 |
API适用国家/地区 | 美国 |
支持语言 | N/A |
Rfam API 服务商
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Rfam是什么公司
更多Rfam是一个由人工策划的非编码RNA家族集合,提供序列比对、共识二级结构和预测的同源物。它由Rfam团队维护,数据可通过FTP、API和公共MySQL数据库访问,遵循CC0许可,鼓励数据的自由使用和科学共享。
Rfam的API接口(产品与功能)
API产品信息
Rfam是一个由人工策划的非编码RNA家族集合,通过序列比对、共识二级结构和预测的同源物来表示。
核心功能
功能模块 | 服务详情 |
---|---|
数据访问 | 提供搜索Rfam、FTP站点、API和公共MySQL数据库等多种数据访问方式。 |
序列搜索 | 支持文本搜索和序列搜索,帮助用户快速定位特定RNA家族。 |
3D结构整合 | 将3D结构整合到SEED比对中,增强RNA家族的表示。 |
基因组注释 | 提供基因组注释服务,帮助用户理解RNA家族在基因组中的作用。 |
Rfam云管线 | 通过Rfam云管线,用户可以进行ncRNA序列的提取和分析。 |
使用场景
- 生物信息学研究:研究人员可以利用Rfam的API和数据库,进行非编码RNA家族的深入研究和分析。
- 基因组注释:基因组学研究人员可以使用Rfam的数据和工具,对基因组中的非编码RNA进行注释和功能预测。
- 教育和培训:Rfam提供的文档和资源,可以作为教学材料,帮助学生和研究人员学习非编码RNA的相关知识。
Rfam API的价格(API免费方式与收费标准)
在选择API服务商时,综合评估以下维度,选择最适合自己需求的API服务商,确保技术兼容性和成本效益。
Rfam API Key怎么获取(API调用与对接教程)
暂无使用与对接教程
Rfam的最佳替代品(竞品对比) (更多)
63%相似度
英国OmniPath
评分 38
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OmniPath是一个分子生物学先验知识数据库,由Saez Lab和Korcsmaros Lab开发。它整合了100多个资源的数据,包含蛋白质-蛋白质和基因调控互作、酶-PTM关系、蛋白质复合体、蛋白质注释以及细胞间通讯。OmniPath提供多种工具和接口,如R/Bioconductor包OmnipathR、Python客户端和Cytoscape插件,支持用户构建和分析信号网络。
61%相似度
美国Bioconductor
评分 51
4
Bioconductor是一个旨在开发和共享开源软件的项目,专注于生物数据分析的精确性和可重复性。该项目促进了一个包容和协作的开发者及数据科学家社区,使用R统计编程语言,每年发布两次,并拥有活跃的用户社区。